13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2393 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4029  hypothetical protein  78.7 
 
 		 169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  32.86 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  29.38 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  25.87 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30.48 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  26.39 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  23.24 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  27.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  26.23 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  27.62 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>