32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0524 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  32.09 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  34.72 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  37.08 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  33.72 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  28.37 
 
 
138 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.47 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  27.87 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25.17 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  35.82 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  24.09 
 
 
284 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  28.8 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  26.09 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  26.09 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  26.15 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  22.7 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  25.93 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  28.21 
 
 
133 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 
149 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  29.82 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  26.03 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  25.36 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  26.03 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.31 
 
 
316 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  28.77 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  28 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  25.89 
 
 
182 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>