27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3272 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  87.12 
 
 		 132 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  85.5 
 
 		 132 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  85.5 
 
 		 132 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  85.5 
 
 		 132 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  69.77 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  68.22 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  69.53 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  63.36 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  60.47 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  57.48 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  54.55 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  54.2 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  53.44 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  57.25 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  50.39 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  50.38 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  49.24 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  47.24 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  40.65 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  33.59 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  34.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  33.06 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2725  protein of unknown function DUF1486  22.22 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00391008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  29.32 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  23.26 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  32.8 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>