52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4153 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  32.23 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  35.94 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  32.8 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  29.6 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  28.99 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1161  protein of unknown function DUF1486  27.41 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.71 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.71 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  28.78 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.86 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.89 
 
 		 316 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  34.29 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  28.06 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  24.22 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  26.76 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  25.62 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  27.13 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30.94 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  23.26 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  34.13 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.89 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  24.03 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  28.85 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.81 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  23.97 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  24.17 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  26.62 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  21.67 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 409 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  23.14 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  26.4 
 
 		 415 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 402 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  26.4 
 
 		 415 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  26.4 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  26.4 
 
 		 415 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  23.53 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  25.19 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 		 407 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  31.4 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  25.55 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  23.89 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  27.82 
 
 		 169 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>