25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3560 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  276  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  71.65 
 
 		 133 aa  200  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  65.38 
 
 		 133 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  65.12 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  63.85 
 
 		 132 aa  186  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  66.93 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  61.6 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  59.68 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  59.52 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  54.76 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  54.69 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  53.91 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  53.91 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  50.39 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  52.34 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  53.97 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  50.78 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  52.85 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  46.51 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  44.35 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  28.79 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  30.16 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  23.53 
 
 		 138 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  29.03 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>