26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4457 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  276  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  98.48 
 
 		 132 aa  273  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  96.97 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  94.66 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  85.5 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  67.97 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  65.89 
 
 		 136 aa  184  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  70.63 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  65.12 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  58.46 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  58.59 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  56.06 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  55.3 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  53.91 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  53.79 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  56.06 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  48.48 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  48.03 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  44.88 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  30.66 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  29.84 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2725  protein of unknown function DUF1486  19.84 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00391008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  27.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  23.14 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>