31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0596 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  93.89 
 
 		 134 aa  257  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  93.13 
 
 		 133 aa  255  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  63.85 
 
 		 131 aa  186  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  65.62 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  63.49 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  60.77 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  59.52 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  60.63 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  58.59 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  57.81 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  57.48 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  57.03 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  56.69 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  59.06 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  55.04 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  51.56 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  49.59 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  46.46 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  37.93 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  25.38 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  26.72 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  31.3 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  33.86 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  31.75 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  32.54 
 
 		 163 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.36 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  31.5 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>