24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0997 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  45.86 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  46.51 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  49.23 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  47.24 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  46.03 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  44.03 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  46.09 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  46.67 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  46.09 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  46.46 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  46.46 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  46.46 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  44.88 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  44.88 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  41.73 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  45.24 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  39.06 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  32.77 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2768  hypothetical protein  33.78 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  23.62 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>