23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1042 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  290  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  65.89 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  63.36 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  65.12 
 
 		 132 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  64.34 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  57.35 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  59.23 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  60.77 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  59.52 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  61.6 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  59.52 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  59.52 
 
 		 132 aa  163  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  63.08 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  56.59 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  48.06 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  46.67 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  40.48 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  34.59 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  27.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  32.28 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>