32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0629 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  99.25 
 
 		 134 aa  274  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  93.13 
 
 		 132 aa  255  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  65.38 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  63.91 
 
 		 133 aa  177  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  61.65 
 
 		 133 aa  173  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  61.72 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  59.52 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  56.15 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  54.55 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  53.44 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  53.44 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  56.69 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  52.71 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  48.82 
 
 		 134 aa  133  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  46.09 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  37.07 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  30.4 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  33.07 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  29.75 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2441  hypothetical protein  28.15 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  30.95 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  29.69 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>