25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2926 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  289  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  69.53 
 
 
133 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  66.91 
 
 
141 aa  183  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  70.63 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  69.84 
 
 
132 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  64.84 
 
 
136 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  67.72 
 
 
132 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  68.25 
 
 
132 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  60.9 
 
 
135 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  63.49 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  62.77 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  61.72 
 
 
133 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  61.72 
 
 
134 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  63.57 
 
 
133 aa  163  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  59.52 
 
 
131 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  60.47 
 
 
133 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  52.42 
 
 
134 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  50.79 
 
 
134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  49.23 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  42.98 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  31.45 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  32.03 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  24.22 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  29.17 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>