23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03632 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  284  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  62.77 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  57.14 
 
 
136 aa  169  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  57.35 
 
 
141 aa  168  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  60.47 
 
 
133 aa  166  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  59.23 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  57.36 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  54.55 
 
 
135 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  59.06 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  57.48 
 
 
134 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  56.69 
 
 
133 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  53.97 
 
 
131 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  52.71 
 
 
134 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  53.91 
 
 
133 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  48.85 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  54.33 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  45.24 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  30.71 
 
 
146 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2768  hypothetical protein  29.17 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>