14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4466 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1161  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  29.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3519  hypothetical protein  28.23 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  29.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  26.89 
 
 		 134 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>