17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2725 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2725  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00391008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.914418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1552  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310863  normal  0.43853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1606  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4472  hypothetical protein  36.13 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1887  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.719699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4198  hypothetical protein  35.04 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351697  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  28.35 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  22.22 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  20.63 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  20.63 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0339  hypothetical protein  30.09 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  19.84 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  19.84 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  29.27 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4119  hypothetical protein  25.49 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1694  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.1 
 
 
314 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.262305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>