31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0972 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  31.19 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  31.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  27.52 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.69 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  37.7 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  37.66 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  35.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2338  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.38 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  26.09 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  30.38 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  32.88 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  30.23 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4298  hypothetical protein  26.54 
 
 		 392 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3467  hypothetical protein  24.43 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0153094  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>