13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2034 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2034  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  25.95 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  29.57 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  28.87 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  25.37 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  25.37 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  24.79 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  27.34 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  23.48 
 
 		 141 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>