235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004143 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  81.45 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  74.44 
 
 		 134 aa  204  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  56.72 
 
 		 135 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  57.69 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  61.83 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  57.25 
 
 		 135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  56.49 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  55.91 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  39.06 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  44.63 
 
 		 204 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  40.32 
 
 		 208 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 199 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  38.71 
 
 		 208 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  38.02 
 
 		 208 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  38.02 
 
 		 208 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  37.5 
 
 		 203 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 197 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  30.33 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  29.03 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  35.64 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  33.66 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.66 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.67 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  23.62 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  34.52 
 
 		 600 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35.58 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  31.37 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  30.91 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  26.72 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  32.69 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  29.09 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  23.81 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.08 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  30.39 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  28.93 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  32.8 
 
 		 188 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  24.03 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.13 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  27.2 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  34.67 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  25 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32.43 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  29.09 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  33.78 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  26.45 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  29.13 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.62 
 
 		 598 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  28.1 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  30.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  29.13 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  28.71 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>