More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004131 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  76.05 
 
 		 528 aa  801    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  75.1 
 
 		 527 aa  768    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  100 
 
 		 529 aa  1059    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  93.01 
 
 		 529 aa  954    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  53.36 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  53.35 
 
 		 559 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  52.76 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  52.87 
 
 		 542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  53.55 
 
 		 544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  51.5 
 
 		 556 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  51.14 
 
 		 541 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  52.77 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  52.39 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 		 552 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  52.66 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  52.47 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  52.39 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  52.39 
 
 		 551 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  52.2 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  52.09 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  53.04 
 
 		 547 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  47.31 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  45.99 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  45.12 
 
 		 528 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  46.05 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.54 
 
 		 531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.58 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  43.05 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.53 
 
 		 545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 		 520 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 558 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 595 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 562 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 566 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 546 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  27.42 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  29.7 
 
 		 720 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 		 592 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 547 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  26.38 
 
 		 564 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  27.06 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  23.37 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 		 566 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  25.38 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  24.77 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 		 571 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.87 
 
 		 567 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  24.08 
 
 		 585 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 567 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 		 566 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.95 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.31 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  25.81 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.41 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.43 
 
 		 662 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 		 567 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.93 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.97 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.42 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  25.81 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  25.35 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 		 606 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  24.82 
 
 		 555 aa  107  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.71 
 
 		 543 aa  106  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  25.57 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  23.52 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.51 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  26.94 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  25.95 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  24.59 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  25.95 
 
 		 562 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  25.83 
 
 		 679 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  26.06 
 
 		 566 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  24.83 
 
 		 576 aa  104  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  23.56 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 577 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.66 
 
 		 539 aa  103  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  26.03 
 
 		 607 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 667 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  26.13 
 
 		 558 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.76 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  26.26 
 
 		 569 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>