160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001007 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  85.43 
 
 		 199 aa  348  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  61.54 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  57.76 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  57.76 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  57.76 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  57.76 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  64.39 
 
 		 150 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  49.16 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  53.85 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  53.42 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  35.64 
 
 		 189 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  34.68 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  36.02 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  39.13 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  32.95 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  29.19 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  27.81 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  27.81 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.93 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.58 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.58 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.56 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  32.03 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  23.33 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  31.41 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  29.82 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  30.41 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  27.38 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28.41 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  29.24 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 404 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.82 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 262 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  29.3 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  23.16 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 547 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.43 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  25.62 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.07 
 
 		 351 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 304 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 301 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  22.94 
 
 		 283 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 275 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 593 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  23.37 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  22.29 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  23.6 
 
 		 284 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  22.28 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.4 
 
 		 380 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 320 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  27.47 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  21.59 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  28.41 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 308 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  22.35 
 
 		 283 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  22.09 
 
 		 292 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  21.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  21.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  22.78 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.38 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 492 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  21.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 570 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>