276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1083 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 447 aa  894    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  72.17 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  69.44 
 
 		 455 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  60 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  59.32 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  59.55 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  59.55 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  59.68 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  62.11 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  62.02 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  58.51 
 
 		 457 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  59.91 
 
 		 444 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  59.33 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  59.41 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  60.36 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  59.1 
 
 		 444 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  58.71 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  60.19 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  59.82 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  57.14 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  56.46 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  58.98 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  55.07 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  49.18 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  48.16 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  54.65 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  53.41 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  45.29 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  45.39 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  46.33 
 
 		 438 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  44.32 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.88 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  44.34 
 
 		 493 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  44.6 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  44.6 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  44.6 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  44.34 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  44.6 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  44.37 
 
 		 438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  42.76 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  46.19 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  44.87 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  45.29 
 
 		 458 aa  325  9e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  43.19 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  43.19 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  38.33 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  36.75 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  46.25 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  42.43 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  40.37 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  40.37 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  40.82 
 
 		 431 aa  299  6e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  37.79 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  40.21 
 
 		 423 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  38.27 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  34.59 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  34.85 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  33.89 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.92 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  22.22 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  27.24 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  22.51 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  26.46 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.76 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.26 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.38 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  36.43 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  25.9 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  25.9 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  35.34 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  22.22 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  21.87 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  25.62 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  26.38 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  20.97 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  21.47 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  23.86 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  36.89 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  23.71 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  22.16 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.75 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  20.29 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  28.06 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  22.39 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  21.76 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  34.75 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.86 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  27.6 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  20.61 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  29.76 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  24.22 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  31.97 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  31.61 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  43.96 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  21.52 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  21.52 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>