More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0715 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  63.11 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  63.11 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  56.31 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  51.98 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  54.37 
 
 		 222 aa  224  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 212 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 212 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  54.68 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 218 aa  217  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  51.46 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  50.97 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 215 aa  211  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 220 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 209 aa  207  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  54.95 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  54.95 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 212 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  51.21 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  54.46 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  56.04 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  50 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 208 aa  201  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>