More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1684 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
450 aa  884    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
466 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
481 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 
460 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  25.23 
 
 
459 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  27.1 
 
 
459 aa  156  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 
488 aa  156  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
476 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 
478 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 
460 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.64 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  28.7 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
317 aa  136  9e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  26.3 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 
460 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 
302 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  25.06 
 
 
460 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
302 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 
308 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
306 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 
308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.88 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  28.97 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1119  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.194456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  25.32 
 
 
337 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 
479 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
328 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 
311 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
313 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  30.64 
 
 
317 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.28 
 
 
311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 
333 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
285 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  29.48 
 
 
316 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
320 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 
285 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
305 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 
308 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  24.6 
 
 
331 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  28.72 
 
 
311 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.12 
 
 
303 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.03 
 
 
302 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  29.07 
 
 
302 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
312 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  23.18 
 
 
332 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 
331 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 
295 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  25.76 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  27.24 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  28.25 
 
 
385 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  26.92 
 
 
302 aa  99.4  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
312 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  26.12 
 
 
297 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
315 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 
304 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.64 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
312 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
339 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
294 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
303 aa  97.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 
309 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
315 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 
295 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 
315 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  26.69 
 
 
303 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 
346 aa  96.7  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28.47 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 
300 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 
305 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  29.11 
 
 
300 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  29.04 
 
 
298 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
293 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
278 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
295 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  28.28 
 
 
302 aa  94  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  28.28 
 
 
302 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 
326 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
299 aa  93.6  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 
293 aa  93.6  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
396 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 
296 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  27.89 
 
 
300 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 
308 aa  93.2  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.2 
 
 
292 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>