55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3618 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  319  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  34.51 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1973  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00891975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  36.46 
 
 		 187 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 136 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.41 
 
 		 139 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 143 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 173 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  32.22 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>