More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0733 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 326 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  58.43 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  57.62 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  57.62 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  57.32 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  57.54 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  55.69 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  55.79 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  57.23 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  55.49 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  55.02 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.62 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  54.69 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  47.81 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.68 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.22 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.59 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  48.92 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  49.51 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  51.84 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  48.26 
 
 		 338 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  47.27 
 
 		 351 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  45.31 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.17 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  45.73 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  44.27 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47 
 
 		 354 aa  241  9e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  44.31 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.68 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  46.01 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  42.04 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  44.44 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  41.31 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.43 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.82 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.98 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.06 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.87 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.29 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.69 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.62 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.35 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.05 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.05 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.59 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.34 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.54 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.6 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.29 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  39.42 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 338 aa  168  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.17 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.44 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  34.49 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.82 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.15 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  32.4 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.09 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  32.9 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  32.98 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.52 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.58 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  33.65 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  33.96 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  32.83 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.89 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.23 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.99 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>