More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0204 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
293 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.59 
 
 
294 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.17 
 
 
294 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.12 
 
 
297 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  54.48 
 
 
297 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.79 
 
 
307 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.29 
 
 
298 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.25 
 
 
293 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 
292 aa  258  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.01 
 
 
296 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.46 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.31 
 
 
296 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.17 
 
 
298 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
294 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.37 
 
 
292 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  49.48 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.61 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.07 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.07 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.07 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.77 
 
 
328 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.29 
 
 
298 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
292 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.72 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.11 
 
 
296 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 
296 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 
296 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 
296 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.54 
 
 
321 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.1 
 
 
295 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.59 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.07 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.07 
 
 
297 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  47.44 
 
 
295 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.58 
 
 
301 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 
297 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 
323 aa  212  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
293 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 
302 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  37.59 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  35.52 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
321 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.38 
 
 
311 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  36.27 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
289 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.34 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
301 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
297 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
298 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
297 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  28.91 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
295 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
330 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.62 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  30.64 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  31.23 
 
 
336 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  31.23 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
318 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
329 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  30.56 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  30.56 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
335 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  30.56 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.03 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.14 
 
 
338 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
323 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>