More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1799 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1799  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
538 aa  1024    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.928165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0322  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  83.75 
 
 
538 aa  824    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600588  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2054  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  60.26 
 
 
543 aa  474  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  58.28 
 
 
542 aa  462  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454821  normal  0.480352 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0651  NADH dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 
616 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.415661  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0653  NADH dehydrogenase (quinone)  35.1 
 
 
611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0520  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
617 aa  161  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0386908  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  36.39 
 
 
657 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000385592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.43 
 
 
1128 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  32.42 
 
 
1152 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.53 
 
 
691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
633 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.8 
 
 
692 aa  120  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07220  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.86 
 
 
643 aa  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000172038  normal  0.975039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.55 
 
 
710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.29 
 
 
654 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.75 
 
 
639 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.75 
 
 
639 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.75 
 
 
639 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.29 
 
 
654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1741  NADH dehydrogenase (quinone)  32.7 
 
 
624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.449294  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.75 
 
 
683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  32.42 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  31.82 
 
 
596 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.72 
 
 
656 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  32.12 
 
 
596 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.32 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1082  NADH dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 
624 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.047689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1570  NADH dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
639 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.161929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  32.27 
 
 
638 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2653  NADH dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
632 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
611 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  35.23 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
611 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.23 
 
 
613 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  35.82 
 
 
613 aa  110  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.64 
 
 
768 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  33.45 
 
 
642 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.64 
 
 
768 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.33 
 
 
971 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.17 
 
 
649 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
613 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.92 
 
 
625 aa  108  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.63 
 
 
639 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.71 
 
 
618 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0778  ech hydrogenase subunit A  33.01 
 
 
648 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00297843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0152  ech hydrogenase subunit A  30.93 
 
 
639 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  34.53 
 
 
615 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
614 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
614 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
614 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.69 
 
 
939 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.79 
 
 
636 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  33.1 
 
 
615 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  32.75 
 
 
616 aa  107  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  30.53 
 
 
603 aa  107  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  31.82 
 
 
616 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_763  hydrogenase, EchA subunit  43.82 
 
 
648 aa  106  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.675229  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  28.53 
 
 
614 aa  106  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  34.4 
 
 
613 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  34.4 
 
 
613 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  34.4 
 
 
613 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.26 
 
 
623 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0024  NADH dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
635 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  31.25 
 
 
612 aa  106  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.53 
 
 
781 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
611 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
611 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  31.77 
 
 
617 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
827 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1624  ech hydrogenase subunit A  48.63 
 
 
663 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.22 
 
 
613 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  31.42 
 
 
624 aa  104  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  32.06 
 
 
615 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3371  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.49 
 
 
661 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  32.06 
 
 
616 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.29 
 
 
667 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3024  ech hydrogenase subunit A  40.24 
 
 
636 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000133717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0860  hydrogenase, EchA subunit, putative  42.13 
 
 
648 aa  104  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.94 
 
 
762 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.94 
 
 
625 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  31.08 
 
 
624 aa  104  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.68 
 
 
649 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.1 
 
 
765 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.87 
 
 
623 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1730  NADH dehydrogenase (quinone)  41.46 
 
 
637 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.48 
 
 
765 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.81 
 
 
642 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  33.1 
 
 
617 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.21 
 
 
643 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  32.75 
 
 
617 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.53 
 
 
911 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  27.95 
 
 
654 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  29.59 
 
 
697 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2724  NADH dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 
619 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481092  normal  0.977803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>