More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0322 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1799  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  83.96 
 
 
538 aa  768    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.928165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0322  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
538 aa  1045    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600588  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2054  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  57.39 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.32 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454821  normal  0.480352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0520  NADH dehydrogenase (quinone)  35.64 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0651  NADH dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 
616 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.415661  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0386908  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0653  NADH dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  36.48 
 
 
657 aa  146  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000385592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.75 
 
 
1128 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
1152 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.76 
 
 
691 aa  123  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  28.73 
 
 
633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.14 
 
 
692 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.04 
 
 
710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.88 
 
 
618 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07220  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000172038  normal  0.975039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1570  NADH dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 
639 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.161929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.72 
 
 
639 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.72 
 
 
639 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.72 
 
 
639 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.97 
 
 
639 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.28 
 
 
625 aa  109  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.55 
 
 
654 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.17 
 
 
683 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.22 
 
 
654 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.98 
 
 
765 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2653  NADH dehydrogenase (quinone)  33.97 
 
 
632 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.6 
 
 
767 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.75 
 
 
642 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.99 
 
 
768 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.99 
 
 
768 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1082  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
624 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.047689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  33.67 
 
 
614 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  33.67 
 
 
614 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  33.67 
 
 
614 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0778  ech hydrogenase subunit A  32.45 
 
 
648 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00297843  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.3 
 
 
649 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1741  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
624 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.449294  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  32.99 
 
 
624 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
613 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
613 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
611 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
611 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  32.75 
 
 
616 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3024  ech hydrogenase subunit A  40.24 
 
 
636 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000133717  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  32.64 
 
 
624 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0024  NADH dehydrogenase (quinone)  37.66 
 
 
635 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  32.27 
 
 
638 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0152  ech hydrogenase subunit A  32.92 
 
 
639 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1624  ech hydrogenase subunit A  34.39 
 
 
663 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.21 
 
 
636 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
596 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.08 
 
 
911 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.69 
 
 
971 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1730  NADH dehydrogenase (quinone)  41.46 
 
 
637 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
596 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
613 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0860  hydrogenase, EchA subunit, putative  42.24 
 
 
648 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  31.47 
 
 
616 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  31.1 
 
 
612 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.73 
 
 
639 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.6 
 
 
667 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.82 
 
 
656 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  33.88 
 
 
615 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
596 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_763  hydrogenase, EchA subunit  42.24 
 
 
648 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.675229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.97 
 
 
623 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  31.73 
 
 
939 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.84 
 
 
781 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  29.61 
 
 
636 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  28.72 
 
 
603 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3371  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.76 
 
 
661 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  31.58 
 
 
615 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.9 
 
 
642 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.55 
 
 
613 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2724  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 
619 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481092  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0364  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 
636 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.478363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
613 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
611 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.45 
 
 
952 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
613 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
613 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  40.55 
 
 
980 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
611 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.4 
 
 
765 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  28.81 
 
 
614 aa  100  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.28 
 
 
827 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.25 
 
 
625 aa  99.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4114  NADH dehydrogenase (quinone)  46.76 
 
 
647 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.589277  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.25 
 
 
643 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  31.71 
 
 
615 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  31.71 
 
 
616 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  28.18 
 
 
610 aa  99.8  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.57 
 
 
623 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>