More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0285 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  100 
 
 
692 aa  1381    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.57 
 
 
691 aa  334  3e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  35.83 
 
 
663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.83 
 
 
634 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.87 
 
 
624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  35.23 
 
 
662 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  36.19 
 
 
666 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  39.15 
 
 
620 aa  299  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.85 
 
 
628 aa  299  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  35.35 
 
 
666 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  34 
 
 
686 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.59 
 
 
656 aa  296  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  36.29 
 
 
643 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  35.13 
 
 
664 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.1 
 
 
641 aa  293  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.18 
 
 
667 aa  293  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
701 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  34.13 
 
 
661 aa  292  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  34.64 
 
 
686 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  33.87 
 
 
686 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  34.17 
 
 
654 aa  291  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  34.88 
 
 
661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.13 
 
 
631 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.88 
 
 
643 aa  290  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  39.22 
 
 
620 aa  290  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  36.2 
 
 
697 aa  290  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.67 
 
 
637 aa  290  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  33.91 
 
 
636 aa  289  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.33 
 
 
667 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  33.18 
 
 
689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.25 
 
 
671 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  33.95 
 
 
692 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  38.76 
 
 
620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  34.12 
 
 
683 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  38.52 
 
 
620 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  38.52 
 
 
620 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  34.36 
 
 
697 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.19 
 
 
667 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.01 
 
 
666 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  35.28 
 
 
688 aa  283  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.03 
 
 
669 aa  283  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  33.92 
 
 
695 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.87 
 
 
642 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  33.14 
 
 
664 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.24 
 
 
687 aa  282  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1058  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.9 
 
 
652 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  38.13 
 
 
620 aa  281  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  37.74 
 
 
620 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  33.53 
 
 
688 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.11 
 
 
627 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.33 
 
 
642 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  37.2 
 
 
768 aa  280  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.09 
 
 
691 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  38.64 
 
 
620 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1289  F420H2 dehydrogenase subunit L  34.56 
 
 
665 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.91 
 
 
710 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.54 
 
 
675 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.73 
 
 
770 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  33.49 
 
 
682 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.83 
 
 
678 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.26 
 
 
614 aa  278  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.99 
 
 
642 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
679 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
679 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
679 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
679 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.17 
 
 
630 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
679 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  38.25 
 
 
620 aa  276  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 
679 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 
679 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.66 
 
 
667 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.62 
 
 
650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.55 
 
 
639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.55 
 
 
639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.55 
 
 
639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  34.63 
 
 
695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.29 
 
 
648 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.8 
 
 
666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.67 
 
 
758 aa  275  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  33.69 
 
 
692 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  38.23 
 
 
604 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.27 
 
 
613 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
611 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  33.19 
 
 
670 aa  273  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
613 aa  272  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
611 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
613 aa  272  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  38.27 
 
 
613 aa  272  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
611 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
613 aa  272  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
613 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.76 
 
 
639 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
613 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
613 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
613 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  33.23 
 
 
684 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.82 
 
 
681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>