More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0520 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0520  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
620 aa  1204    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0651  NADH dehydrogenase (quinone)  81.12 
 
 
616 aa  923    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.415661  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0653  NADH dehydrogenase (quinone)  73.19 
 
 
611 aa  805    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  80.5 
 
 
617 aa  912    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0386908  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 
657 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000385592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.78 
 
 
691 aa  278  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  39.69 
 
 
692 aa  262  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.78 
 
 
1128 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 
1152 aa  216  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  29.28 
 
 
636 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.03 
 
 
642 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  34.41 
 
 
596 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.97 
 
 
642 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  33.87 
 
 
596 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.15 
 
 
648 aa  206  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0014  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.95 
 
 
655 aa  206  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1434  NADH dehydrogenase subunit L  31.13 
 
 
600 aa  205  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  33.47 
 
 
596 aa  203  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.34 
 
 
646 aa  203  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  29.23 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.19 
 
 
650 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.27 
 
 
621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.96 
 
 
641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  30.65 
 
 
654 aa  198  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  31.67 
 
 
633 aa  198  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.21 
 
 
683 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  30.4 
 
 
666 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.81 
 
 
726 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  30.26 
 
 
666 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1817  NADH dehydrogenase subunit L  31.21 
 
 
640 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000815464  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.63 
 
 
649 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.68 
 
 
642 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.61 
 
 
636 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  27.64 
 
 
621 aa  193  9e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  30.37 
 
 
688 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0762  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.82 
 
 
612 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136316  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.36 
 
 
654 aa  192  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.67 
 
 
624 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  31.82 
 
 
636 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.69 
 
 
656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  30.96 
 
 
663 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.41 
 
 
800 aa  190  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  29.85 
 
 
643 aa  190  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.41 
 
 
800 aa  190  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.01 
 
 
639 aa  190  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.01 
 
 
639 aa  190  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.01 
 
 
639 aa  190  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.16 
 
 
654 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.4 
 
 
618 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.9 
 
 
650 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.9 
 
 
642 aa  188  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  29.96 
 
 
664 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  33.26 
 
 
612 aa  188  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  30 
 
 
614 aa  187  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0167  NADH-quinone oxidoreductase chain l  29.38 
 
 
603 aa  187  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30 
 
 
645 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0595  NADH dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 
640 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.61 
 
 
628 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.68 
 
 
654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.93 
 
 
686 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  29.13 
 
 
661 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  30.36 
 
 
701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  29.56 
 
 
661 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  28.81 
 
 
683 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  30.65 
 
 
697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  30.05 
 
 
662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.41 
 
 
725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  28.65 
 
 
695 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  31.22 
 
 
638 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.38 
 
 
637 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.19 
 
 
625 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  30.02 
 
 
620 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  29.73 
 
 
688 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.74 
 
 
634 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.42 
 
 
630 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  32.73 
 
 
657 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  32.73 
 
 
657 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  28.82 
 
 
664 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.22 
 
 
642 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.33 
 
 
958 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  30.87 
 
 
634 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.06 
 
 
801 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.78 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.65 
 
 
681 aa  180  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  31.57 
 
 
638 aa  180  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  25.93 
 
 
685 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.48 
 
 
643 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  29.55 
 
 
697 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.8 
 
 
625 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.33 
 
 
800 aa  179  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.36 
 
 
639 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
633 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000430257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.74 
 
 
799 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0322  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.81 
 
 
538 aa  179  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600588  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.48 
 
 
959 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.27 
 
 
624 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.46 
 
 
672 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.72 
 
 
775 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.05 
 
 
671 aa  177  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.83 
 
 
627 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>