89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1709 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1709  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2128  transcriptional regulator, MerR family  93.04 
 
 		 159 aa  295  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2382  putative transcriptional regulator, MerR family  48.28 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123415  hitchhiker  0.000694345 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0167  putative transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.200853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4514  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.267969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4461  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 258 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1319  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.228927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 258 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 242 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  42.03 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2743  putative transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  26.83 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  31.94 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  41.38 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 246 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 139 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 137 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 146 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  40.28 
 
 		 172 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.99 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2291  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2201  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0876  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 243 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  27.85 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 96 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>