156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1206 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  57.53 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  57.92 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  57.92 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  58.38 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  42.54 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  40.21 
 
 		 194 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  39.15 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  40.21 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  40.21 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  40.66 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  40.66 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  39.66 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  40.66 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  40.66 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  38.71 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  40.56 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  40.21 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  37.29 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  37.57 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  38.98 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  38.98 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  39.43 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  37.64 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  40.74 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  40.44 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  35.42 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  37.57 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  40.78 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  39.08 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  39.66 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  39.89 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  43.09 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  39.43 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  37.99 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  37.31 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  39.23 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  34.09 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  38.42 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  39.53 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  37.36 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  35.91 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  36.76 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  34.76 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  37.04 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  38.51 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  34.08 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  35.23 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  34.43 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  35.52 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  36.96 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  34.62 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  36.46 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  33.33 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  36.61 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  34.78 
 
 		 357 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  30.73 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  29.63 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  29.38 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  31.43 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  32.58 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  32.58 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  33.16 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  32.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  31.84 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  31.84 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  31.84 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  31.67 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  29.78 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  29.63 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  31.15 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  31.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  31.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  31.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  30.05 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  31.07 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  29.53 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  29.14 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  33.52 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  30.17 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  33.52 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  29.19 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  30.94 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  30.94 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  30.94 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  30.94 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  31.84 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  31.49 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  30.9 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  30.56 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  29.17 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  30.43 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  29.17 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  30.6 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  30.39 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>