More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2424 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  848    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  86.21 
 
 		 428 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  77.75 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  74.83 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  73.95 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  72.13 
 
 		 441 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  69.41 
 
 		 448 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  66.9 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  68.94 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  68.43 
 
 		 437 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  68.43 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  66.28 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  67.85 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  67.74 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  66.12 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  63.26 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  67.22 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  55.94 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  59.4 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  60.05 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  59.27 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  62.98 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  57.5 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  57.47 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  59.03 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  58.58 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  57.24 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  57.24 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  57.44 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  57.14 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  52.76 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  57.31 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  55.16 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  57.98 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  56.94 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  48.92 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  46.24 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  49.07 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  45.99 
 
 		 427 aa  355  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  44.81 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  55.25 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  42.15 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  42.15 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  42.39 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  44.25 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.13 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 429 aa  319  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  44.9 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  38.83 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.02 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>