More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1837 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  71.15 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  67.66 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  64.35 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  59.28 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  62.86 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  58.44 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  56.79 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  57.34 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  56.46 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  54.15 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  52.89 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  50.65 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  54.46 
 
 		 242 aa  204  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  50.21 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  52.42 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  51.24 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  49.03 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  51.75 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  52.14 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  54.21 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  47.77 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  48.67 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  46.3 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  48.46 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  44.83 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  47.14 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  45.96 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  48.92 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  49.3 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 411 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.69 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.82 
 
 		 427 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 401 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 440 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 206 aa  88.6  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 196 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.58 
 
 		 382 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 402 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 378 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 412 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 370 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  31.38 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.05 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.05 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.05 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.15 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.8 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>