85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3240 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  59.04 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  59.57 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  39.57 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  34.07 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  31.94 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  32.47 
 
 		 161 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  32.47 
 
 		 161 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  34.38 
 
 		 163 aa  94.4  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  32.48 
 
 		 161 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  32.7 
 
 		 161 aa  91.3  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  31.45 
 
 		 161 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.24 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  31.13 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  30.57 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  31.29 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  30.46 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  28 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  33.87 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  29.14 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  26.67 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  28.67 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  29.3 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  28.03 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  28.03 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  28.03 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  25.83 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  26.49 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  26.49 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  27.5 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  27.39 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  30 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  27.39 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  28.66 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  27.39 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  27.39 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  26.75 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  27.74 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  27.1 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  25.81 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  26.14 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  26.83 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  23.64 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  23.64 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  26.25 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  25.29 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  25.29 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  24.71 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  26.06 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  23.53 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  26.06 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  25.16 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  25.16 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  23.87 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  31.07 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  24.39 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  31.31 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  24.52 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  27.91 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  25.16 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25.3 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  24.22 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  24.71 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  27.04 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  23.03 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  27.54 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  28.57 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  24.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  26.43 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  25.77 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  23.61 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  25 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  27.84 
 
 		 162 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  22.79 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  25.77 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.77 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  25 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  22.56 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  25 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.77 
 
 		 162 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.55 
 
 		 165 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  25.89 
 
 		 184 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  22.16 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  21.74 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>