More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2558 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  100 
 
 
351 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  46.69 
 
 
342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  46.69 
 
 
342 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  37.1 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  35.5 
 
 
338 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  37.5 
 
 
348 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  34.31 
 
 
334 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  36.48 
 
 
360 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  34.97 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.22 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  36.97 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  30.81 
 
 
630 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  34.96 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  34.07 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  32.39 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  35.71 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.69 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.94 
 
 
437 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.97 
 
 
480 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  37.82 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.59 
 
 
503 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  36.97 
 
 
243 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  35.29 
 
 
238 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  35.29 
 
 
238 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.62 
 
 
569 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  33.33 
 
 
437 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  33.06 
 
 
440 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  33.06 
 
 
440 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  32.54 
 
 
484 aa  62.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  30.37 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  32.89 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  46.15 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.02 
 
 
541 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  42.47 
 
 
482 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  30.43 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  30.37 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  28.99 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.61 
 
 
554 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.23 
 
 
474 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  46.15 
 
 
454 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  33.87 
 
 
599 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40.91 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.15 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  30.58 
 
 
447 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  30.15 
 
 
472 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.33 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  46.15 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  28.42 
 
 
286 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  31.16 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  29.61 
 
 
300 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  30.58 
 
 
475 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.45 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  31.16 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  31.16 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  31.16 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  31.52 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  43.94 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  31.52 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  31.34 
 
 
304 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  30.58 
 
 
468 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  31.16 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  37.38 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40.3 
 
 
412 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  31.15 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.81 
 
 
293 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  28.89 
 
 
475 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  31.15 
 
 
440 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.91 
 
 
375 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  30.43 
 
 
441 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.45 
 
 
375 aa  59.3  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  30.43 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  30.43 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.45 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.21 
 
 
465 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.62 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  30.43 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  44.62 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3254  peptidase M23B  30.6 
 
 
234 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.91 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  27.94 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  29.86 
 
 
282 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  29.13 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  31.54 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  31.67 
 
 
507 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  34.45 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  41.54 
 
 
459 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  31.71 
 
 
592 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  28.68 
 
 
490 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  40.24 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>