More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3361 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  68.46 
 
 		 298 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 316 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  55.22 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  23.7 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0270  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0053  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0050  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5891  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0160  transcription regulator protein  30.21 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  27.86 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2706  transcriptional regulator, LysR family  26.54 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.173124  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1637  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0994273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4564  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53731  normal  0.180488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1652  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2522  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00304048  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1674  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126025  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2079  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843078  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2452  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1529  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2614  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000028926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0392  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2178  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1743  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2051  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1312  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0063  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2847  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3150  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>