More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3122 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
573 aa  1166    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  56.46 
 
 
546 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
566 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
557 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
551 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
577 aa  352  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
561 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.01 
 
 
582 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.83 
 
 
561 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
563 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
563 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
563 aa  349  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
563 aa  349  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 
561 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 
561 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
582 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
539 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 
561 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
559 aa  342  8e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.59 
 
 
561 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
577 aa  340  4e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 
579 aa  333  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
577 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 
583 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
569 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.19 
 
 
562 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
573 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
585 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 
563 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 
561 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 
562 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.86 
 
 
562 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 
560 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
579 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
579 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
559 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.4 
 
 
557 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.42 
 
 
562 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 
514 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.42 
 
 
562 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 
572 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
591 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
564 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 
563 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
557 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 
562 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
557 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
557 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
562 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.97 
 
 
572 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 
557 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  34.02 
 
 
560 aa  309  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.89 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
562 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
561 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 
561 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
553 aa  306  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.85 
 
 
557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
590 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 
527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
562 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
566 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
599 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
533 aa  303  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 
569 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 
557 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 
583 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 
560 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
583 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 
561 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  34.28 
 
 
550 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 
554 aa  299  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.91 
 
 
562 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
551 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 
567 aa  299  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
572 aa  299  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
558 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 
565 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.85 
 
 
565 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 
565 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
583 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 
558 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 
559 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 
566 aa  297  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 
559 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
561 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>