More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 		 546 aa  1100    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  56.46 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 559 aa  320  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 566 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 563 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 563 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 582 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 557 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 		 561 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 561 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.39 
 
 		 561 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 577 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 549 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 521 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  36.87 
 
 		 508 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.07 
 
 		 491 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 561 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 572 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 565 aa  269  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 569 aa  267  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 518 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.34 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.65 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 579 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.65 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 562 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 562 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 		 557 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 554 aa  260  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 584 aa  260  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 		 557 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 		 563 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 505 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 562 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 499 aa  259  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 579 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 569 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 599 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.51 
 
 		 565 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.01 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 540 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 560 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 		 557 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 584 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.99 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 560 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>