215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2005 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
324 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  71.38 
 
 
330 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  60.92 
 
 
330 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  57.53 
 
 
332 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  56.67 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  57.19 
 
 
336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  53.61 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  52.48 
 
 
337 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  52.11 
 
 
332 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  56.52 
 
 
369 aa  341  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  57.72 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  54.41 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  53.96 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  52.74 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  55.96 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  51.35 
 
 
352 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  52.8 
 
 
387 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  53.61 
 
 
352 aa  332  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  50.61 
 
 
342 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  52.78 
 
 
330 aa  322  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  51.5 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  54.09 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  50.6 
 
 
341 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  51.06 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  52.24 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  53.12 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  53.12 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  53.12 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  51.29 
 
 
328 aa  308  8e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  50.78 
 
 
362 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  52.62 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  50.31 
 
 
400 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  53.29 
 
 
342 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  50.31 
 
 
360 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  47.42 
 
 
399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  46.32 
 
 
398 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  47.42 
 
 
399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  47.42 
 
 
399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  52.15 
 
 
338 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  47.69 
 
 
399 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  48.61 
 
 
334 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
337 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  45.96 
 
 
397 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  46.78 
 
 
419 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  47.88 
 
 
474 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  53.74 
 
 
337 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  52.35 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
337 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
337 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40.61 
 
 
331 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.74 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  41.38 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.64 
 
 
321 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.75 
 
 
360 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 
339 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.22 
 
 
308 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
320 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.2 
 
 
321 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.17 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 
325 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.8 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 
346 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.85 
 
 
329 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
359 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 
335 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41.46 
 
 
344 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  40.99 
 
 
322 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.06 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  38.64 
 
 
322 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  51.58 
 
 
310 aa  221  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.81 
 
 
312 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.36 
 
 
334 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  38.11 
 
 
311 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
313 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  46.21 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40.12 
 
 
344 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  38.61 
 
 
306 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  44.3 
 
 
373 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  38.61 
 
 
307 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  37.62 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.21 
 
 
312 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.07 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  42.14 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  37.01 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  37.07 
 
 
327 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  36.65 
 
 
329 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
314 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  37.07 
 
 
327 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  39.44 
 
 
328 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  39.75 
 
 
328 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  36.02 
 
 
327 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 
319 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  43.23 
 
 
338 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>