62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0215 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  100 
 
 		 263 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  57.44 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  42.32 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  46.64 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  42.94 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  46.01 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  46.93 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  37.7 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  37.57 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.05 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  42 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  42.31 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  42.4 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  35.03 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  44.44 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  40.38 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  38.39 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  40.66 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  37.36 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  29.14 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  34.29 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 519 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  47.27 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  26.94 
 
 		 316 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  47.37 
 
 		 218 aa  49.3  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  25.83 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  26.49 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  25 
 
 		 330 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  25.17 
 
 		 336 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4420  hypothetical protein  44.95 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204685  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  32.94 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  27.51 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.11 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 322 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  28.4 
 
 		 310 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>