82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1716 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 366 aa  729    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1643  ABC-2 type transporter  95.08 
 
 		 366 aa  700    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  36.06 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1584  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  22.49 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.64 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.33 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.84 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  21.13 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.58 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.49 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  22.49 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  22.36 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  20.48 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  24.19 
 
 		 928 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.39 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  23.45 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  24.4 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.21 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  22.09 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  22.09 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.28 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  22.22 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  30.15 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  21.18 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  20.87 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  20.69 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  27.93 
 
 		 904 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  20.39 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  21.67 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.63 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  22.66 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  22.26 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  22.66 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  22.66 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  22.66 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.14 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  21.47 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  21.13 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>