49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1073 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 329 aa  679    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  58.36 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  51.75 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  43.71 
 
 		 365 aa  278  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  41.55 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  41.5 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  39.49 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.49 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.11 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.07 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  21.95 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.62 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  27.21 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  31.52 
 
 		 573 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.49 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  21.84 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  27.84 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  29.38 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27.8 
 
 		 483 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.67 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  28.42 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  24.63 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  20.3 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  21.2 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.31 
 
 		 705 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.69 
 
 		 673 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 		 501 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  22.93 
 
 		 486 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.63 
 
 		 551 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.36 
 
 		 869 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  24.39 
 
 		 1115 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.51 
 
 		 863 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26.92 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  23.7 
 
 		 590 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 660 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.36 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  38.1 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  24.05 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  34.85 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 847 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>