More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0947 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  96.97 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  67.44 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  65.38 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  64.57 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  59.85 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  58.14 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  59.85 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  52.27 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  56.8 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  51.91 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  51.15 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  163  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  57.69 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  54.62 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  56.35 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  53.49 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  58.73 
 
 		 133 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  55.3 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  55.12 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  53.85 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  52.27 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  53.08 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  53.38 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  51.94 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  55.81 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  55.38 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  51.59 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  52.31 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  54.4 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  51.88 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  56.9 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  55.37 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  51.11 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  52.34 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  51.59 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  47.66 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  44.96 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  49.23 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  49.23 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  44.7 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  48.51 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  46.97 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  45.24 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.1 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  40.46 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  45.08 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  40.15 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  46.9 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  45.24 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  45.71 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  46.02 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  38.17 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  46.46 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  53.4 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  39.2 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  50.43 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  48.67 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  45.69 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  45.69 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  45.22 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  38.84 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  46.61 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  42.62 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  42.86 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  39.53 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  38.64 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  46.22 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  41.98 
 
 		 160 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  42.62 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  48.6 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  43.65 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.1 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  41.6 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  45.9 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  36.84 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  44.25 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  43.59 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>