More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2718 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  77.18 
 
 		 249 aa  390  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  58.02 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  58.02 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  57.02 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  56.79 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  55.79 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  59.18 
 
 		 251 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  55.14 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  56.73 
 
 		 258 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  55.79 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  58.26 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  57.55 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  55.37 
 
 		 250 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  54.51 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  57.45 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  57.39 
 
 		 253 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  57.83 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  57.83 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  57.83 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.96 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  56.07 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  54.92 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  54.73 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  56.96 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.25 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  55.04 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  56.96 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 262 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 262 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  54.62 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  54.78 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  55.65 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  55.04 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.58 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 269 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  55 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  54.96 
 
 		 269 aa  234  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.9 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  50.62 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  49.59 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  49.17 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  52.99 
 
 		 631 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  52.1 
 
 		 629 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  49.57 
 
 		 288 aa  214  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  49.57 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  44.67 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50.67 
 
 		 327 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  51.27 
 
 		 629 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  52.47 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  52.47 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4281  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 316 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 		 347 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  48.7 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 736 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  52.02 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 		 368 aa  207  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  45.53 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  45.53 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0760  ABC transporter related  47.21 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  50.45 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  48.25 
 
 		 572 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 695 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.77 
 
 		 327 aa  205  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  46.7 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 		 325 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 		 680 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  45.34 
 
 		 309 aa  204  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.89 
 
 		 322 aa  204  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 328 aa  204  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0152  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 		 327 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.7 
 
 		 575 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.39 
 
 		 531 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1811  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.72 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>