More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1706 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1706  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  38.89 
 
 		 165 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  31.93 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  38.18 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  35 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  36.14 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  32.18 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  39.02 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  34.12 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  35.33 
 
 		 166 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  34.29 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  35.33 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  35.93 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 		 408 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  42.52 
 
 		 415 aa  88.6  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  32.48 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  34.73 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  33.55 
 
 		 275 aa  88.2  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  34.73 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  34.73 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.09 
 
 		 411 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  35.93 
 
 		 166 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  30.11 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.86 
 
 		 411 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 414 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.92 
 
 		 403 aa  87  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  35.76 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  35.2 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  30.06 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  35.5 
 
 		 427 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  35.48 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  33.71 
 
 		 415 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  31.64 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  36.14 
 
 		 162 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 421 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  33.92 
 
 		 160 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  31.64 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  32.32 
 
 		 156 aa  85.1  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 421 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.81 
 
 		 421 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  35.76 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  32.93 
 
 		 161 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.09 
 
 		 408 aa  84.3  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  36.26 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.67 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  34.27 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  31.64 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  30.11 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  35.57 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  31.11 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1822  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.6 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3059  NAD+ synthetase  37.6 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  35.07 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  31.84 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  36.69 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0470  NAD+ synthetase  37.6 
 
 		 514 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  32.18 
 
 		 430 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  28.8 
 
 		 429 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  30.48 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  30.64 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  31.07 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  31.82 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  31.21 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  35.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  32.39 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  31.43 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  30.29 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  31.87 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  30.64 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  30.17 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  38.52 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  34.1 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  32.78 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  29.94 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  31.07 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.74 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  29.07 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  31.11 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  31.52 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  40.17 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  31.52 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  33.97 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  31.52 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  30.68 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  33.12 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  33.12 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  37.1 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  34.18 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  31.18 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  32.58 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  32.95 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  35.98 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>