More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12091 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  67.4 
 
 
228 aa  320  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  66.96 
 
 
228 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  66.96 
 
 
228 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  41.18 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  41.35 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  41.44 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  37.44 
 
 
249 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  41.96 
 
 
245 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
244 aa  141  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
248 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 
297 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
295 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.13 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.97 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
290 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
298 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.44 
 
 
296 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
290 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.59 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.42 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  28.3 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  29.67 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.68 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  27.51 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  26.85 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  26.91 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 
296 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  29.68 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
415 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 
409 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  26.46 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  26.69 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  29.77 
 
 
326 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  29.77 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  31.9 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  27.53 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  27.96 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  27.96 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  27.96 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  23.94 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  27.49 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.56 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  28.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.56 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.29 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  29.72 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.44 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  28.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.56 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.56 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  28.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  24.66 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.57 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  27.38 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.11 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.68 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>