More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2247 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.08 
 
 		 862 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 		 858 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 871 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 896 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.57 
 
 		 854 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 		 913 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 870 aa  748    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 892 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 860 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 892 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 890 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 894 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 872 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 		 891 aa  700    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 895 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.54 
 
 		 865 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  47.91 
 
 		 926 aa  822    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 823 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  67.37 
 
 		 885 aa  1202    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 		 900 aa  685    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.7 
 
 		 868 aa  675    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  69.86 
 
 		 854 aa  1203    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 863 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 869 aa  685    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  45.72 
 
 		 896 aa  759    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 		 870 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 892 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  55.2 
 
 		 905 aa  859    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 873 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  54.05 
 
 		 903 aa  804    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 872 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 		 882 aa  693    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 892 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  45.25 
 
 		 913 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 882 aa  1795    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  54.47 
 
 		 927 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  49.44 
 
 		 863 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 881 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  66.82 
 
 		 888 aa  1182    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 868 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 890 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 869 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 881 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  44.79 
 
 		 913 aa  786    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  52.06 
 
 		 908 aa  825    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  66.94 
 
 		 907 aa  1134    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  45.28 
 
 		 898 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 887 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 		 897 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.61 
 
 		 858 aa  652    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.92 
 
 		 873 aa  739    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 		 870 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 872 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 892 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  48.15 
 
 		 926 aa  828    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 890 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 910 aa  710    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 910 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 867 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  63.77 
 
 		 901 aa  1159    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  66.94 
 
 		 888 aa  1185    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 892 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  46.16 
 
 		 850 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44 
 
 		 859 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 		 914 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  43.48 
 
 		 858 aa  679    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  45.5 
 
 		 932 aa  743    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 857 aa  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  68.11 
 
 		 854 aa  1194    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 853 aa  731    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 857 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.31 
 
 		 889 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 		 859 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 928 aa  632  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 		 903 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 880 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 857 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 882 aa  631  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 857 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 857 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 873 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  43.08 
 
 		 887 aa  628  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 872 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 837 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 872 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 872 aa  625  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 875 aa  625  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 		 868 aa  624  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 868 aa  625  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 853 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 860 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 861 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 		 872 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 910 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 859 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 		 855 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 853 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>