More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1994 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0666  cystathionine gamma-synthase  84.62 
 
 
392 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.161507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1994  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
380 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.855521  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21181  putative cystathionine gamma-synthase  76.86 
 
 
389 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04071  putative cystathionine gamma-synthase  70.21 
 
 
389 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.749469  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1743  putative cystathionine gamma-synthase  69.41 
 
 
389 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04601  putative cystathionine gamma-synthase  68.88 
 
 
389 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04591  putative cystathionine gamma-synthase  60.05 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04281  putative cystathionine gamma-synthase  60.86 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0850994  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0404  putative cystathionine gamma-synthase  60.05 
 
 
387 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04701  putative cystathionine gamma-synthase  58.71 
 
 
387 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.95 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.95 
 
 
390 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.95 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 
390 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  43.72 
 
 
385 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.36 
 
 
397 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  42.44 
 
 
380 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.2 
 
 
378 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.44 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.73 
 
 
388 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.55 
 
 
381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  46.83 
 
 
390 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.27 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.74 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.55 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.53 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.11 
 
 
379 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.76 
 
 
398 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.46 
 
 
386 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.44 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.51 
 
 
381 aa  308  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
386 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  39.73 
 
 
379 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  44.06 
 
 
388 aa  305  6e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.73 
 
 
388 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 
386 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 
383 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  42.67 
 
 
386 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.91 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.77 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.64 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.02 
 
 
388 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  42.52 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 
393 aa  299  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 
380 aa  299  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 
393 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.32 
 
 
383 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  45.22 
 
 
400 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  44.88 
 
 
405 aa  297  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 
393 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.59 
 
 
383 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 
389 aa  296  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  45.86 
 
 
405 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.99 
 
 
426 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 
380 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.58 
 
 
386 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 
400 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.69 
 
 
387 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  42.11 
 
 
378 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.69 
 
 
387 aa  292  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  44.96 
 
 
394 aa  292  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  38.95 
 
 
386 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  42.33 
 
 
390 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.36 
 
 
426 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 
380 aa  291  9e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  42.48 
 
 
381 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  45.81 
 
 
385 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.1 
 
 
379 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.11 
 
 
390 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 
390 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.42 
 
 
387 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  40.68 
 
 
379 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 
387 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 
387 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  42.52 
 
 
387 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
393 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  41.55 
 
 
390 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  40.94 
 
 
426 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.87 
 
 
389 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.69 
 
 
378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.33 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.26 
 
 
387 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 
379 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  40.37 
 
 
387 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  45.63 
 
 
411 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  42.55 
 
 
391 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  41.04 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  41.51 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  39.2 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  40.84 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>