More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0358 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  82.92 
 
 		 439 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  82 
 
 		 439 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  84.74 
 
 		 439 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  84.97 
 
 		 439 aa  705    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  94.99 
 
 		 439 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 439 aa  851    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  82.23 
 
 		 439 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  88.61 
 
 		 439 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  81.78 
 
 		 439 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  86.1 
 
 		 439 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  66.97 
 
 		 439 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  62.95 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  61.36 
 
 		 437 aa  522  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  63.04 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  63.37 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  63.15 
 
 		 438 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  61.66 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  44.66 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.67 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  42.35 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  42.39 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.6 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.06 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 437 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.9 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.1 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.55 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.55 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.8 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  41.27 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.55 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.98 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  40.41 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  41.18 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  43.03 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.66 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.49 
 
 		 443 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.05 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.18 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  41.46 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.39 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.23 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 		 426 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  42.49 
 
 		 444 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 443 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.19 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 		 442 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  42.45 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  42.25 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.55 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.55 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.86 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.72 
 
 		 447 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  40.65 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  41.75 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  42.75 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  40.73 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  41.92 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  42.15 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 446 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  41.75 
 
 		 453 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  293  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  39.02 
 
 		 437 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.86 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>