More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2844 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
404 aa  830    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  76.67 
 
 
401 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  68.16 
 
 
407 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  63.09 
 
 
402 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  63.25 
 
 
401 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  63 
 
 
401 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
401 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
401 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  63.5 
 
 
401 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  63 
 
 
401 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
401 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  62.25 
 
 
401 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  60.05 
 
 
404 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  56.82 
 
 
398 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  57.78 
 
 
400 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  54.3 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
418 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
421 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  34.16 
 
 
420 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
419 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 
420 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
420 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
420 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
420 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
419 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
420 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
421 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
416 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  32.61 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  29.9 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  30.12 
 
 
426 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  29.44 
 
 
416 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
431 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
417 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 
448 aa  156  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25.46 
 
 
446 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
392 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 
466 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 
436 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
410 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
395 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 
398 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.53 
 
 
403 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
411 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
411 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  26.14 
 
 
410 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.19 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.71 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  27.06 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
448 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 
411 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  23.42 
 
 
454 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
393 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
388 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 
401 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
396 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
350 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
412 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
375 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  28.85 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
396 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.86 
 
 
401 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 
419 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
431 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
448 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.5 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  27.5 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  28.24 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  25.78 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
429 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 
402 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
356 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 
868 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.34 
 
 
369 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>